截至年7月，呼伦贝尔市共辖14个行政区，包括2个市辖区、5个县级市、4个旗、3个自治旗，分别是海拉尔区、扎赉诺尔区、满洲里市、扎兰屯市、牙克石市、根河市、额尔古纳市、阿荣旗、新巴尔虎左旗、新巴尔虎右旗、陈巴尔虎旗、莫力达瓦达斡尔族自治旗、鄂伦春自治旗、鄂温克族自治旗。呼伦贝尔市人民政府驻海拉尔区友好六街。
市辖区
1.海拉尔区
海拉尔区，隶属于内蒙古自治区呼伦贝尔市，是呼伦贝尔市人民政府所在地，是呼伦贝尔市政治、经济、文化、医疗、教育、交通、信息、旅游中心，面积.8平方公里。
2.扎赉诺尔区
扎赉诺尔区，隶属于内蒙古自治区呼伦贝尔市，由满洲里市代管。扎赉诺尔区西北靠满洲里市区，总面积平方公里。
“扎赉诺尔”是呼伦湖的习惯称谓，意为“海一样的湖”。扎赉诺尔煤炭地质储量亿吨，是一座因煤而兴的工矿城市，煤炭、电力、化工、加工制造、商贸物流、文化旅游是扎区的支柱产业。
县级市
3.满洲里市
满洲里，由内蒙古自治区呼伦贝尔市代管，是内蒙古自治区计划单列市，是中国最大的陆运口岸城市，总面积平方公里。
满洲里是一座拥有百年历史的口岸城市，融合中俄蒙三国风情，被誉为“东亚之窗”。
4.牙克石市
牙克石市，内蒙古自治区呼伦贝尔市下辖县级市，位于呼伦贝尔市中部，总面积平方公里。
牙克石市是内蒙古大兴安岭政治、经济、文化、医疗和交通中心。“牙克石”系满语音译，意为“要塞”，素有“中国森林工业之都、中国冰雪之都”、国家森林康养基地（第一批）的美誉。
5.扎兰屯市
扎兰屯市是呼伦贝尔市下辖县级市，是内蒙古岭东地区政治、经济、文化、医疗、交通中心，呼伦贝尔副中心城市，中国优秀旅游城市，呼伦贝尔市商品交易中心之一。
扎兰屯市位于内蒙古自治区东部，全市行政区域总面积1.69万平方公里。
6.额尔古纳市
额尔古纳市是内蒙古自治区呼伦贝尔市下辖县级市，位于内蒙古自治区呼伦贝尔市大兴安岭西北麓，呼伦贝尔草原北端，额尔古纳市面积2.84万平方公里。
额尔古纳市因额尔古纳河而得名，蒙古语为“捧呈、敬献”之意，素有“呼伦贝尔缩影”的美誉，是呼伦贝尔的城市名片。
7.根河市
根河市是内蒙古自治区呼伦贝尔市下辖的县级市，“根河”是蒙古语“葛根高勒”的谐音，意为“清澈透明的河”。
根河总面积2.万平方公里，是中国纬度最高的城市之一，年平均气温-5.3℃，极端低温-58℃，年封冻期天以上，是中国最冷的城市，素有“中国冷极”之称。
旗
8.阿荣旗
阿荣旗是隶属内蒙古自治区呼伦贝尔市的一个旗，位于大兴安岭东麓，面积平方公里。县境内有那吉屯农场、格尼河农场。著名景点有东光朝鲜民族村，抗联英雄园，金界壕，库伦沟林场等。
9.鄂伦春自治旗
鄂伦春自治旗，隶属于内蒙古自治区呼伦贝尔市，全旗总面积平方公里，是呼伦贝尔市面积最大的县级行政区，素有“北国碧玉”、“绿色净土”、“鲜卑民族发祥地”之美誉。
10.莫力达瓦达斡尔族自治旗
莫力达瓦达斡尔族自治旗是内蒙古自治区呼伦贝尔市下辖自治旗，成立于年8月15日，是全区三个少数民族自治旗之一，是全国唯一的达斡尔族自治旗，面积平方公里。
11.鄂温克族自治旗
鄂温克族自治旗，隶属于内蒙古自治区呼伦贝尔市，地处位于内蒙古自治区东北部，土地总面积平方公里。著名景点有维纳河矿泉、巴彦胡硕旅游区、红花尔基森林公园等。
12.陈巴尔虎旗
陈巴尔虎旗隶属内蒙古自治区呼伦贝尔市，位于中国内蒙古自治区呼伦贝尔市西北部，地处呼伦贝尔大草原腹地，土地面积平方公里。著名景点金帐汗部落、呼和诺尔旅游景区。
13.新巴尔虎左旗
新巴尔虎左旗是隶属内蒙古自治区呼伦贝尔市的一个旗，位于呼伦贝尔市西南端，土地面积2.2万平方公里。著名景点有甘珠尔庙、“诺门罕战争”遗址。
14.新巴尔虎右旗
新巴尔虎右旗是自治区19个边境旗（市）和23个牧业旗之一，位于祖国东北边陲，呼伦贝尔市西部中俄蒙三国交界处。东北部与全国最大的陆路口岸城市满洲里毗邻，面积平方公里。